@lijiang

Sculpting in time

Do one thing and do it well.
Every story has a beginning and an end.

1 分钟

[email protected][email protected]

先从主要的原理入手,[email protected]只是预测能够Binding Covid-19外层刺突蛋白的人工合成药物的分子结构,可以想象成类似摄影中的拍照技术,Rosetta能够静态的预测某一个蛋白质的特征,但是它无法预测该蛋白质分子在时间的演化下是如何运作的,因为分子之间会有电势差异,产生电磁力的作用,所有分子内部的构成元素都会随着时间的变化相互影响而产生运动,当我们在Rosetta中设计出一种能够绑定SARS-COV-2病毒的合成药物时,需要进入测试阶段,观察该药物是否能稳定的与病毒蛋白质结合,因为预测的结构是静态的,我们无法知道蛋白质结构在相互作用运动的情况下是否能够很好的与病毒蛋白质结合,这里[email protected]就派上用场了,它就类似于摄影中的拍摄动态画面,我们可以从[email protected]上拿到静态的蛋白质结构链,然后在[email protected]中模拟该蛋白质随着时间的推移是否能够很好的与病毒蛋白质结合,从而产生抵抗病毒的作用。

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我会关闭之前一直在运行的[email protected],目前[email protected]已经发表了论文,预测出了能够结合SARS-COV-2的人工蛋白质结构,所以现在需要做的就是进行大量分子动力学模拟,并且[email protected]已经支持ARM64架构,我会把自己运行的算力全部迁移到[email protected],期望全世界的感染人数能够降下来,使得经济能够复苏。

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