@lijiang

Sculpting in time

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NVIDIA Clara Discovery Platform

英伟达2020 GTC 人工智能辅助药物研发

1 分钟

NVIDIA CLARA DISCOVERY

生态

Nvidia进军医疗领域,从封面我们可以看到一个环状结构:

自然语言 -> 病毒基因序列 -> 病毒蛋白质结构 -> 新药物与病毒蛋白质对接 -> 分子对接动力学模拟 -> 候选药物临床试验检测病人肺部医疗影像 -> 自然语言

简介

在Nvidia GTC 2020秋季大会上,Nvidia发布了NVIDIA CLARA DISCOVERY 药物研发框架,目的就是加速全球药物研发的进度,之前Nvidia收购ARM的消息,我就意识到未来Nvidia有想要统治边缘计算领域的野心。不出所料,这次GTC发布会上Nvidia更新了很多产品线,包括大到数据中心的计算模块BlueField-2,小到边缘领域jetson Nano 2G,最让我激动的还是CLARA DISCOVERY,因为自己短期的目标就是如何将边缘计算用于医疗领域,比如个人可以通过边缘计算设备结合自己从医院检查获得的诊断数据来计算出自身疾病的现状,还有对Covid-19 CT,ChestXRay的判断检测。

是什么

Clara Discovery 集成了很多框架和应用,包括基因序列分析,蛋白质对接和结构预测,分子动力学模拟,医学图像识别和分割,自然语言处理。

基因序列生成

NVIDIA Clara Parabricks Collection

图像处理

NVIDIA Clara Imaging

蛋白质结构

RELION

MELD

分子动力学模拟

GROMACS

VMD

NAMD

重点

NVIDIA Clara Imaging 主要分为两部分:

Clara Train SDK -> 用于训练模型

架构图:

Getting started with Clara Train SDK

Clara Deploy Bootstrap -> 将模型部署到kubernets集群中

架构图:

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